日前有媒体报道称，《全国股转公司列13条红线标准，不达标企业将无缘新三板》。这13条红线包括“环保问题未落实的”、“企业开展业务必备资质未办理且可能带来重大法律风险的（如重大行政处罚的） ”、“企业存在重大行政处罚不符合挂牌条件的”等。不过股转系统在29日晚间辟谣称，该报道与事实不符。
全国股转公司表示，“未设挂牌准入13条红线”，并一直严格按照《全国中小企业股份转系统业务规则(试行)》规定的挂牌条件、《全国中小企业股份转让系统挂牌准入条件适用标准指引(试行)》以及有关挂牌条件适用若干问答解答开展挂牌准入审查工作，未发布其他所谓的挂牌准入“红线”，挂牌准入标准未发生变化。有消息称，上述“13条红线“是由某券商根据某次内核培训所做的总结。
虽然被辟谣，但从去年底开始，新三板的监管力度就开始大幅提升。就在今年1月29日，由于对圆融科技等16只股票以明显低于最近成交价的价格进行卖出申报，造成上述股票尾盘价格大幅波动，国泰君安遭到了新三板的顶格处罚。
在2月底，长城证券也遭到了股转系统的点名。由于长城证券未切实履行投资者适当性管理职责，在投资者适当性认定及开通投资者权限方面存在违规行为，被股转系统采取了出具警示函、责令改正的自律监管措施。
数据显示，2015年全年，股转系统先后对31家主办券商、2家做市商采取了自律监管措施。今年，针对券商做出的自律监管措施有6次，包括上文中的国泰君安和长城证券。随着挂牌企业数量的不断增加，监管趋严也成了新三板发展的必然趋势。
4月1日，《全国中小企业股份转让系统主办券商执业质量评价办法（试行）》就将实施，这个评价办法将会根据推荐挂牌、挂牌后督导、交易管理、综合管理四类业务对主办券商进行评分，据此实施差异化监管。所有已取得推荐、经纪或做市业务备案函的所有主办券商都将被纳入评价系统。
随着监管趋严，不少券商新三板业务部的相关运作模式正在发生变化。据了解，准备挂牌新三板的企业在满足股转系统硬条件的基础上，还需要满足一些附加条件。不少主办券商内部提高了接单的要求，对准新三板企业提出了规模、利润等多方面的限定条件。
